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Journée L’organisation du vivant : Actualités et perspectives

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Etude des dynamiques d’un réseau de gènes
Denis Mestivier (univ. Paris VII)

18 novembre 2004

Nous présentons un modèle de régulation de gènes de la région de décision du bactériophage lambda. Cette région sert pour le virus à "décider" entre programmes au moment de l’infection de la bactérie : programme lytique (le virus se réplique et détruit la bactérie) ou programme lysogénique (le virus intègre son génome dans celui de la bactérie et sera reproduit en même temps au moment de la division bactérienne). Ce réseau est composé d’éléments de régulation très simples (1 ou 2 promoteurs, 1 ou 2 gènes, 3 opérateurs) et il pourrait laisser croire qu’il "ne fait pas grand chose".
Pourtant, la formalisation de ce réseau et son analyse théorique montrent une grande richesse d’adaptation. Nous présentons comment on formalise les connaissances biologiques pour construire un modèle, puis quels comportements dynamiques sont attendus en fonction de paramètres biologiques. L’analyse des bifurcations, ces valeurs des paramètres où le comportement du réseau au cours du temps va changer brutalement, est présentée. Nous nous concentrerons sur les paramètres suivants : taux de dégradation des protéines et constantes d’affinité des protéines sur leurs opérateurs, ces paramètres pouvant être modifiés expérimentalement afin de tester les prédictions de ce type de modèles.

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Denis Mestivier Denis Mestivier (univ. Paris VII)
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