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Journée L’organisation du vivant : Actualités et perspectives
organisé par Jean-Antoine Lepesant (Institut Jacques Monod)

Vignette grande

Etude des dynamiques d’un réseau de gènes
Denis Mestivier (univ. Paris VII)

[18 novembre 2004 à 16h00]

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Nous présentons un modèle de régulation de gènes de la région de décision du bactériophage lambda. Cette région sert pour le virus à "décider" entre programmes au moment de l’infection de la bactérie : programme lytique (le virus se réplique et détruit la bactérie) ou programme lysogénique (le virus intègre son génome dans celui de la bactérie et sera reproduit en même temps au moment de la division bactérienne). Ce réseau est composé d’éléments de régulation très simples (1 ou 2 promoteurs, 1 ou 2 gènes, 3 opérateurs) et il pourrait laisser croire qu’il "ne fait pas grand chose".
Pourtant, la formalisation de ce réseau et son analyse théorique montrent une grande richesse d’adaptation. Nous présentons comment on formalise les connaissances biologiques pour construire un modèle, puis quels comportements dynamiques sont attendus en fonction de paramètres biologiques. L’analyse des bifurcations, ces valeurs des paramètres où le comportement du réseau au cours du temps va changer brutalement, est présentée. Nous nous concentrerons sur les paramètres suivants : taux de dégradation des protéines et constantes d’affinité des protéines sur leurs opérateurs, ces paramètres pouvant être modifiés expérimentalement afin de tester les prédictions de ce type de modèles.

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Journée L’organisation du vivant : Actualités et perspectives

Journées de l’Institut Jacques Monod (CNRS, Paris VI et Paris VII).
La question fondamentale que pose la vie concerne les mécanismes qui conduisent à l’émergence de systèmes complexes ayant la capacité de remplir des fonctions.
Au-delà de la compréhension de la nature du code génétique et de son expression, il nous faut donc comprendre comment les molécules du vivant interagissent à différentes échelles pour générer des systèmes cohérents et fonctionnels au niveau cellulaire et des organismes. Ainsi, l’Institut Jacques-Monod est structuré en trois départements qui abordent respectivement l’étude des génomes, des cellules et du développement. L’atmosphère y est très collégiale et la collaboration entre les équipes au sein de chaque département et entre les départements y est vivement encouragée.
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